科学家运用根据言语模型的深度学习办法来进行精确的RNA 3D结构猜测—小柯机器人—科学网
香港中文大学李煜等研讨人员协作运用根据言语模型的深度学习办法,做精确的RNA 3D结构猜测。该研讨于2024年11月21日在线发表于世界一流学术期刊《天然办法学》。
研讨人员提出了RhoFold+,一种根据RNA言语模型的深度学习办法,可以从序列中精确猜测单链RNA的3D结构。经过集成对约2370万个RNA序列进行预练习的RNA言语模型,并使用技能处理数据缺少问题,RhoFold+为RNA 3D结构猜测供给了一个彻底自动化的端到端管线。
对RNA-Puzzle和CASP15天然RNA靶点的回忆性评价标明,RhoFold+优于包含人类专家组在内的现有办法。经过跨家庭和跨类型评价以及时刻检查基准,进一步验证了其有效性与普遍性。此外,RhoFold+可以猜测RNA二级结构和螺旋间角,研讨人员供给了经历验证的特征,并扩展了其在RNA结构和功用研讨中的适用性。
据了解,精确猜测RNA的3D结构仍然是一个未处理的应战。确认RNA的3D结构关于了解其功用和为RNA靶向药物开发和组成生物学规划供给信息至关重要。RNA的结构灵活性导致试验确认数据的稀缺性,使核算猜测作业复杂化。